紧接着很快知道了后续消息。阎应元派出两千锦衣卫到北直隶各州府重新招兵，每个招一百人，交代全都要吃苦耐劳，性情刚直的“良家子”。招满二十万人以后经过初步比试淘汰，留了十万人组建新的京营重新开始训练。
训练的内容沈飞非常熟悉，就是在《神雕》世界里干过的，按戚继光的练兵步骤，练胆气、练耳目、练手足、练心力、练营阵、练军器。定期公开测试淘汰，缺额部分再重新招募训练，没有铁饭碗。
阎应元在面见崇祯时提出现在这种办法也只是应急，真正的京营应该汇聚全国精锐军队，定期轮流调集各地精锐组成。这有点像明初建立的京操制度，后来就逐渐废弛变质，变成了各地派人进北京当农民工给权贵干活，受苦受累没有好处。要改变这种状态，就要制度上保障京营服役的利益和优势，让天下将士都把进入过京营服役视作荣耀。
阎应元建议京营军饷更高。在国子监下建立军校，在京营任职的基层将官三年期满后可以优先进入国子监军校，军校学成的优秀毕业生，武职可以担任大将、都督。转文职可以担任尚书，进入内阁。不进入军校的其他将官，提拔升迁时也优先，转文职更容易成为地方和朝廷主官，退役优先安排职位。
对于士兵阎应元和崇祯商量决定了京营轮换制度，三年一换。每三年将官可以升迁转调，士兵可以回乡，否则时间一长就会腐化。京营三大营，正好一年轮换一营，有军情需要，也派出一营就够，三营互相制约防止意外。
阎应元对京营的定位是野战军，守城另设京城民兵，用京城本地居民和京营分开训练，这需要统计京城人口、职业，查清壮丁人数，登记造册，以使抽调壮丁进行守城训练。紧急时，民军也可以作为京营的后备力量，这样才能万无一失。崇祯表示人口普查不仅北京需要，全国都要进行。
接着阎应元又提前制造精良火器的话题，崇祯之后接见了毕懋康听取意见，毕懋康的观点很多与沈飞在《神雕》世界里的吻合，手榴弹和地雷效果最好，宋代的铁壳火球、明代的击贼神机石榴炮，只是明代的黑火药配比硝石超过七成，已经很接近最佳配比了。地雷戚继光发明的钢轮发火柜是现成的，可以作为很多火器的击发装置。
火炮方面，毕懋康也认为笨重的红夷大炮只适合摧坚攻城，野战对付来去如风的骑兵效果不好，推荐一些轻型火炮，比较外形像重机枪的翼虎炮，长三尺重六十斤，有柄有架，比起虎蹲炮重一些，同样可以伴随行军野战。
重型火炮方面，综合红夷大炮和佛朗机优势的神飞炮，子母炮的设计避免炮管过热和炸膛，有一千斤、八百斤、六百斤各种形制，最重的母炮一千斤，五门八十斤子炮，配备多种弹药，攻城可以用二十五斤合口弹（就是和口径同样大小的炮弹），攻击集群人马可以用两种霰弹，两百个平均二两的石弹或五百个平均一两的铁弹，杀伤力远远比红夷大炮强。
火枪方面毕懋康称赞鸟铳的威力和精度，可以射穿铠甲，精度能击中钱眼，鸟铳的名称不仅是指形似鸟嘴，确实可以击落飞鸟，有效射程大概150米。建议阵列轮番发射，连续不断，虽然历史上《军器图说》是崇祯八年才完成，这时也提出了改装机发装置，用火石机发的思路。
接着说到火器质量问题，认为到明代的冶炼技术和欧洲的铸造技术合起来最好，铁心铜体炮是欧洲没有的独创，提到红夷炮其实是葡萄牙人雇佣广东佛山铁匠铸造，南方广东工匠卖给民间和欧洲人的火器制作精良，给官府打造的质量就很糟糕，这是赵士祯书中就提到过的。
崇祯指出这是没有严格的奖惩制度的原因，建虏强征的匠人制造的兵器都很精良。把偷工减料，制造兵器质量不合格的处严刑张榜示众，兵器制造优良的除了报酬还可以给予功名甚至爵位，明初有工匠提升为工部尚书，现在也可以这么办。工匠可以举报官员贪污工料钱，查实后对犯罪官员抄家没收财产，一半奖励给举报者。
毕懋康赞同这些措施。崇祯就任命毕懋康以都察院右副都御史身份监管火器局，像整顿京营一样彻底整顿火器制造。主要就是三条，一进南方广东工匠技术好，就去南方大量招募工匠，不怕多花钱。二是武器打造基地不能集中在北京一处，在别的地方另选四处火器制造工厂。三是除了制造，在北京在招募各种有奇思妙想的人研发新型火器，尤其是毕懋康说的自生火铳，作为第一项重点研发项目，以便大规模制造装备军队。
崇祯正在陆续安排各项工作，为最后摊牌实行“先军政治”作前期准备。沈飞也开始安排校事营前期工作，一是寻访安剑清说的武功可能还在穆人清之上的普照大师的下落。二是调查搜集武林中人犯罪的档案，像温南扬这样已经判决了的杀人逃犯直接让各地上报案卷，没有结案的也着手调查搜集案情和证据。建立今后凡是武林中人犯罪除了在当地立案另送一份案卷交给锦衣卫校事营的制度。
另外趁着京营还处于新兵训练阶段，沈飞完颜萍带着安剑清跑了一趟南京，把大功坊卖了下来。小说中闵子华说一个月前才买下来，不过那是十几年以后的事情了，现在的产业肯定不在他手里。锦衣卫改组以后威势已经今非昔比，要办个买房过户手续很容易，闵子华买价是四千三百两，焦宛儿说便宜了，为了避免别人说闲话，沈飞出了六千两。
虽然没有藏宝图，不过大功坊里面柴房没有几个，很容易找到了十个藏宝箱子，打开一一难看，确实是上面一半各种珠宝翡翠、珊瑚玛瑙、珍珠钻石、猫儿眼祖母绿之类，下面一半是金砖。按明初的经济条件估算，金砖换算成白银大概有几百万两就不错了，至于珠宝值多少钱就要看商业运作了。
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