桓温率军在杏花村安营扎寨以后，深感自己对部队的控制力度太弱，痛定思痛后，桓温决定对军队按现代军队思想进行改编，史称杏花改编。
但是古代不同于现代，民主制度大家都没有听过，并且主仆意识深入骨髓，在这样的情况下不可能建立民主制度，也不可能创建类似于党派的组织。
根据具体事情具体分析的精神，桓温决定依据当前时代的社会形态，以及封建制度下的等级观念和主仆意识，设计一套适用当前阶段的组织架构。
魏晋承袭东汉末年的世兵制，所谓世兵制，就是强制乡民世代为兵，这些世代为兵的乡民，也称军户，所以也称军户制，军户制人身依附性较强，男丁终身为兵，父死子继，兄死弟继，不准更改，并且也不准退役，这也就是为什么军中有那么多老弱兵残的原因了。
到了东晋，由于长期内乱，军户负担过重，士兵大量逃亡，世兵制开始没落，朝廷又开始实行募兵制，这次派孙恩前往琅琊和东海去募兵，也是遵循旧例。
晋代军队，五人为一伍，设伍长，两伍为一什，设什长，十什为一队，设队长，队为部队的基本单位，十队为一军，军又分上、中、下三种，上下军两千人，中军一千五百人。
为了不影响历史，桓温决定还是按照旧的编制执行，但是监军一职一般是设在军，为了方便控制军队，桓温决定将监军设在队上，即每百人设一监军，监军一般由文官来担任，文官熟读史书，知耻辱、懂廉耻，可以更好的帮助士兵做思想教育工作。
经过改编，桓温将现有的三千人编为两个军，周楚孙恩各领一军，每个军设十五个队，一共派出十五个监军，同时又模仿现代军队建立起了直属他本人的侦察队、运输队、卫生队、通讯队，每个队大约三十人至五十人左右，这四个队直属桓温各人领导，机动灵活，方便指挥，史称：杏花改编。
经过改编，桓温基本上掌控了整个部队，除了周楚直接指挥的那一百人的小队，说什么也不肯交出来，而且桓温隐约觉得，那一百人的小队，应该就是整个部队当中，最有战斗力的了。
为了避免以后再出现政令不畅的现象发生，桓温决定找个机会跟周楚好好谈谈。
一个月朗星稀的夜晚，周楚打猎的时候抓了一支鹿，他把这支鹿显给了桓温，桓温很高兴，就在院子里生起了篝火，大家一起烤着鹿吃。
望着滋滋冒油的鹿肉，阵阵香味飘过，二人喜不自胜，就着温好的米酒，各自用小刀割着已经烤好的鹿肉，大快朵颐起来。
酒足饭饱之后，二人也敞开了话题，桓温装过不经意的向周楚问起了他的身世，周楚几杯酒下肚，也敞开了心菲，开始向桓温倒起了苦水来。
原来，这周楚出自军户世家，自祖父时候起就世代为兵，一连几代皆是战死，军户在古代职业当中，是连平民都不如的，所以周楚打小就被人瞧不起，这也养起了他谨小慎微的性格。
他知道自己终有一天也会像他的父辈一样，战死沙场，可是，自己到现在还没有结婚，家中年迈的母亲尚在，周楚也是一个极孝之人，所以，这也是周楚一直避战的原因。
桓温听了后，虽然有些同情周楚，但是对他的话也是半信半疑，毕竟他身上的疑点太多，仅从身世上来讲，那比他惨的人太多了，当时整个中原地区，汉人被屠杀的只剩下四百万，若大的中原只剩下四百万汉人，连现代的一个大县的人口都不如，想想就恐怖。
桓温见周楚敞开了心菲，索性就打破砂锅问到底，又向周楚问起了那一百人小队的事情，为何别的小队的人都是缺胳膊断腿，面黄肌瘦的，而他亲率的那个小队，为何一个个都精神饱满、容光焕发的。
周楚看了一眼桓温，似乎并不想回答这个问题，他轻声的叹了口气，向桓温说道：“桓大人，你可知道乞活军吗？”
“乞活军？好奇怪的名字啊。”桓温下意识的说道。
周楚看着桓温那少见多怪的样子，不觉得冷笑了一声，继续说道：“永嘉之乱时，北方胡人南下中原，大肆屠杀抢掠，中原百姓十不存一，尤其以并州为最，并州刺史司马腾，为了活命，带着百姓及官吏两万余人，南下求食，结果处处受到打压排挤，无奈之下，司马腾将这两万余人组织起来，编成军队，号称乞活军，这支军队，没有财产住所，只为乞活求食，所有士兵都是死士，打起仗来无所顾及，十分勇敢强悍。”
“那现在呢？这支军队在哪？”桓温对这支部队很感兴趣，所以连忙问道。
“远在天边，近在眼前。”周楚邪魅一笑，冷冷的对桓温说道。
“啊。”桓温立马站了起来，有点惊讶的说道：“难道你们...你们这些人就是...就是乞活军？”
周楚继续笑道：“不能全算乞活军，只能说，有一部分曾经是乞活军，乞活军不属于任何政治势力，他们只为自己而活，所以谁给他们饭吃，他们就跟着谁。”
桓温也意识到了自己有些失态，于是就又慢慢的坐了下来，继续问道：“那这么说，乞活军也有不少，为敌人所用了？”
周楚点了点头，继续说道：“乞活只是一个统称，他们就是为了活命而生存的，由于战斗力太强，所以开始被各方势力所拉拢；但是这支部队，没有编制，官方也不承认；最早的一支乞活军，就是并州刺史司马腾那一支，他也是最早打出乞活旗号的；后来一些流民，为了活命，也打出了乞活的旗号，再加上一些留守在北方的汉族大地主，他们为了自保，开始修建坞堡对抗外面的势力，为了不被其他势力所攻击，他们也打出了乞活的旗号，意思就是只求活命，不求其他。”
见桓温意犹未尽的样子，周楚又继续说道：“当今天下，打着乞活旗号的乞活军主要有四支，一支关中流民组成的乞活军，他们被氐族首领李雄利用，攻入四川，建立了大成国；另一支是并州司马腾留下的那一支，现在的首领叫冉闵，已经归附赵国石虎，改名为石闵，；第三支是由冀州流民所组成，他们向北逃亡到辽东，被那里的鲜卑首领慕容光收留，并帮助慕容光建立了燕国；第四支是由凉州流民组成，他们被另一个氐族首领杨飞龙收留，建立了仇池国，至今，应该有三代了吧。”
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